1999年12月，吉林市公交总公司新辟46路，起讫站为通潭大路柴草市，后随着解放大路全线贯通调整为清源桥热力公司农林街，热力公司站先后更名为汽车六公司、公交集团。

2011年05月01日，吉林公交集团46路（清源桥公交集团农林街）调整走向，起讫站调整为公交集团农林街，取消由清源桥始发的车辆，并同步增加48路班次。

2015年10月15日，吉林公交集团46路（公交集团农林街）拆分为46路、146路。146路的起止站为“公交集团吉草高速”

2016年09月10日，吉林公交集团46路、146路（公交集团农林街、公交集团吉草高速）合并，取消农林街终到的线路，起讫站调整为公交集团吉草高速（现沈吉高速），路号为46路。

2024年07月10日，为了更好地迎合我市夏季夜间文旅休闲热潮，吉林公交集团匠心打造“夏夜畅游，公交伴行”专项服务行动，规划推出12条季节性夜间延时公交线路，旨在以更加贴心的服务，点亮市民的夏夜生活，让便捷公交成为连接城市繁华与居民幸福的桥梁。 【延时线路，全城覆盖】 1线、3线、4线、8线、12线、25线、30线、45线、46线、130线、140线、336线等共计12条公交线路，将延长夜间服务时间，末班车收车统一延至晚23:00。使夜间城市公交覆盖各条主干道，更紧密串联起夜间灯光璀璨的景观带与繁华的商超餐饮经济区，为市民消暑休闲、购物观光提供强有力的交通支持。 【服务升级，贯穿夏季】 夏季延时服务将由7月10日持续至10月10日止，贯穿激情四溢的夏季，直至金秋十月国庆佳节后，以上12条线路恢复正常首末班服务时间。在此期间我们将密切关注城市活动和天气变化情况，遇有道路管制或降雨等特殊天气时，将适时调整或暂停延时服务。

2024年10月11日，因天气转凉，吉林公交集团夏季延时服务结束。其中1路、4路、12路、30路、45路、140路恢复原末班车时间；3路、8路、130路末班车调整为21：00分别由景山路、长春广场、哈达湾发出；46路末班车调整为21：30由公交集团发出；25路末班车调整为20：00由公交三公司发出。