2016年12月21日，因沾益城区道路规划，部分路段禁止左转，为满足市民的公交出行需求，特结合沾益城区道路规划实际，曲靖市公共汽车总公司对3路、33路（曲靖至沾益方向）部分站点进行调整： 3路（曲靖至沾益方向）取消站点：九龙湖、沾益交警大队。新增站点：区文化体育局、玉林广场。 33路（曲靖至沾益方向）取消站点：玉林广场、农业局。新增站点：小花园、沾益区政府、沾益区一中。

2018年12月20日，根据曲靖市住房和城乡建设局《关于曲靖中心城区公交票价调整的批复》（曲建复[2018]63号），曲靖市公共汽车总公司决定对曲靖中心城区所属公交线路票价进行调整。现公告如下： 一、采用一票制乘车， 二、调价标准： 1、单边营运里程5公里内（含5公里）的公交线路（社区巴士），维持原票价1元/人次。包含线路：S1路。 2、单边营运里程5—20公里（含20公里）的公交线路，票价由1元/人次（含1.5元/人次），调整为2元/人次。包含线路：1路、2路、3路、4路、5路、6路、7路、9路、10路、11路、16路、17路、19路、21路、22路、23路、31路、32路、33路、36路、37路、61路、68路。 3、单边营运里程20—30公里（含30公里）的公交线路，票价调整为3元/人次。包含线路：12路、62路。 4、公交快线票价调整为3元/人次。包含线路：K1路。 三、优惠措施： 1、IC卡刷卡乘车优惠不变，按照学生卡6折、成人卡8折执行。 2、现役军人、老年人、残疾人，票价调整后按照有关政策实行免费乘车。

2019年05月23日，根据曲靖市麒麟区城市综合管理局工作要求，曲靖市公共汽车总公司对3路（珠江源大剧院沾益客运站）进行线路延伸，起讫站调整为公交金牛停车场（西）沾益客运站。新增站点：公交金牛停车场（西）（起始站）、花柯路、珠江源大剧院（东）。线路调整后，运营时间、票制票价不变。

2019年11月12日，因紫云路公交金牛停车场门口路段安装中心隔离栏，曲靖市公共汽车总公司对3路（公交金牛停车场（西）沾益客运站）进行局部优化调整，起讫站调整为公交金牛停车场沾益客运站。新增站点：公交金牛停车场（起始站）、消防支队（去）、张三口（去）、潇湘路口（去），取消站点：公交金牛停车场（西）（起始站）、花柯路（去）、珠江源大剧院（东）（去），回程线路不变。

2020年02月05日，为有效切断新型冠状病毒传播途径，确保人民群众生命安全，根据《中华人民共和国传染病防治法》等法律规定及曲靖市和麒麟区已发布的暂停道路客运班线及其它客运的公告要求，结合省委、省政府公共卫生事件一级响应工作部署及市、区疫情防控工作要求。经研究，曲靖市公共汽车总公司决定暂停和调整曲靖市主城区公交线路，以便防控工作有效开展，自零时起暂停运营：2路、3路、6路、7路、9路、10路、11路、12路、16路、17路、19路、21路、31路、33路、36路、37路、61路、62路、68路、S1路、S3路。保障运营线路：（共7条）1路、4路、5路、22路、23路、32路、K1路，运营时间7:30－18:30（上午7:30－8:30，下午17:30—18:30时段每20分钟一班，其余时段每小时一班），恢复时间视疫情处置情况另行通知。

2020年03月01日，根据曲靖市交通运输系统新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控工作领导小组办公室关于企业复工复产和疫情防控的工作部署，结合我市疫情防控现状和客流实际，为更好地满足市民日常公交出行需求，曲靖市公共汽车总公司决定自零时起，全面恢复市区28条（1路、2路、3路、4路、5路、6路、7路、9路、10路、11路、12路、16路、17路、19路、21路、22路、23路、31路、32路、33路、36路、37路、61路、62路、68路、K1路、S1路、S3路）公交线路运营。疫情防控期间，运营时间统一按早7:00开班，晚19:00收班执行。

2020年07月01日，为进一步优化线网布局，缓解道路拥堵，曲靖市公共汽车总公司对3路、6路进行局部优化调整，3路（公交金牛停车场沾益客运站）缩线行驶，起讫站调整为麒麟花园（北）沾益客运站。取消站点：公交金牛停车场、消防支队（去）、张三口（去）、潇湘路口（去）、雄业金城百货（回）、花柯路（回）、珠江源大剧院（东）（回）、珠江源广场、新百大（原阿诗玛）、玄坛。6路（万宇商贸城公交金牛停车场）缩线行驶，由万宇商贸城上行方向行至圆通路口右转进入圆通路，直行至胜峰东路口左转到达“寥廓公园（北）”终到站。回程由“寥廓公园（北）”站始发，行至园林路“第一人民医院（西）”站后回原线行驶。起讫站调整为万宇商贸城寥廓公园（北）。取消站点：花柯路、公交金牛停车场（终到站）。线路调整后，运营时间、票制票价不变。

2022年04月01日，曲靖市公共汽车总公司3路（麒麟花园（北）沾益客运站）线路延伸，起讫站调整为小河底公交枢纽麒麟花园（北）。新增站点：小河底公交枢纽（起始站）、玉光村、沾益区集贸市场。线路调整后，运营时间、票制票价不变。

2022年11月20日，根据沾益区疫情防控工作要求，曲靖公交3路临时缩线行驶，线路临时调整为小河底公交枢纽大为小区。

2022年11月25日，根据沾益区疫情防控工作要求，曲靖公交3路临时缩线行驶，线路临时调整为麒麟花园（西）兴福村镇银行。

2022年12月06日，按照疫情防控工作要求，前期受麒麟区、沾益区疫情管控影响临时缩短运营线路及临时停止运营的曲靖公交3路、12路、茨营胡家坟定制公交专线、31路、32路、33路、35路、36路、37路、39路、K1路恢复正常线路运营。