1998年12月28日，昆明市公共汽车总公司新辟66路，起讫站为小西门西南批发市场。

2007年09月15日，为减少人民路、环城路等中心城区的线路重复，缓解潘家湾车场出入口的交通压力，弥补和扩大黑林铺、高新区、南市区等主城外围片区公交覆盖，依托岷山立体公交停车场正式启用，昆明公交集团将对11条线路进行优化调整，具体如下：6路（六路车场高峣）缩线行驶，起讫站调整为公交岷山车场高峣；附6路（六路车场龙门村）缩线行驶，起讫站调整为公交岷山车场龙门村；7路（潘家湾（公汽车场）昭宗大村）线路调整，起讫站调整为公交岷山车场市体育馆；54路（大观楼昙华寺（金澳门娱乐城））线路延伸，起讫站调整为公交岷山车场昙华寺，并同步新辟快速公交K2线联合运营，起讫站为公交岷山车场昙华寺；55路（黄土坡理工大学白龙校区（白龙寺））线路延伸，起讫站调整为高新开发区理工大学白龙校区（白龙寺）；66路（高新开发区云铜时代年华小区）线路延伸，起讫站调整为公交岷山车场云铜时代年华小区；95路（东站（公汽车场）西华园）线路调整，起讫站调整为大观楼世博园；103路（潘家湾民航机场）线路调整，起讫站调整为火车北站民航机场，并同步划归昆明新巴北部公司运营管理；116路（马街（西山汽车客运站）海源寺村）线路调整，起讫站调整为公交岷山车场云南财贸学院西区（黄土坡岔口）。为减少部分路段线路重复，同步停止运营53路（菊花村六路车场）、102路（火车北站岷山）。

2008年02月27日，为配合小西门“龟背立交”断交施工，昆明公交集团66路临时调整，去程按原线行驶至西昌路，经西昌路回原线行驶，来回复行。临时新增站点：篆塘（昆医附一院）、新闻路口、弥勒寺（回）。临时取消站点：潘家湾（去）、小西门、艺术剧院、国防路。

2011年03月05日，为适应公交客运市场发展需要，增加公交服务多样性，进一步提升公交服务品质，满足市民出行需求，昆明公交集团新辟公交特色服务专线1路专线、52路专线、55路专线、62路专线、66路专线、69路专线、72路专线、74路专线、82路专线、83路专线、84路专线、90路专线、107路专线、118路专线、129路专线、140路专线、148路专线。公交特色服务专线起讫站与原有线路一致，优先选用大容量、高舒适度车型，专线车实行“优质高效”特色公交服务票制票价，票价按两元/人次执行，仅使用普通公交IC卡，使用学生卡、爱心卡、优惠卡的乘客乘坐特色服务专线车可选择使用卡内电子钱包或投币。

2014年01月11日，为配合地铁3号线省博物馆站（暂定名）结构建设，昆明公交集团66路（眠山车场云铜时代年华小区）线路临时调整，去程不变，回程按原线行驶至东风西路口，经东风西路至南屏街西口调头后回原线行驶。新增站点：南屏街西口（回）。线路调整后，运营时间、票制票价不变。

2015年12月，昆明公交集团66路（眠山车场云铜时代年华小区）、93路（梁家河车场云铜时代年华小区）终到站更名，起讫站同步调整为眠山车场年华街/梁家河车场年华街。

2016年10月，昆明公交集团66路（眠山车场年华街）、93路（梁家河车场年华街）终到站更名，起讫站同步调整为眠山车场时代年华小区（年华街）/梁家河车场时代年华小区（年华街）。

2020年02月22日，按照昆明市应对新型冠状病毒感染肺炎疫情工作领导小组指挥部《关于恢复和调整昆明市道路、水路旅客运输及主城区部分城市公共交通运营的通告》有关要求及工作安排，昆明公交集团将部分恢复昆明市主城区公交线路。因疫情防控需要，线路将采取“跨站停靠”运行模式，具体恢复运营线路如下：1路、2路、3路、4路、5路、8路、9路、10路、23路、26路、32路、44路、54路、55路、61路、62路、66路、69路、72路、75路、79路、82路、83路、84路、89路、90路、91路、96路、101路、104路、105路、108路、111路甲、111路乙、113路、116路、118路、119路、127路、129路、146路、161路、168路、171路、191路、213路、236路、K9路、K12路、K15路、K19路、Z27路、Z28路。恢复线路将严格落实有关防控措施，切实维护公共卫生安全，乘车需佩戴口罩，对不佩戴口罩的乘客，公交驾驶员及监督员将劝导其佩戴口罩，乘客上下车时应主动完成“云南疫情通”扫码登记。