2023年04月20日，为满足福田区沙头街道新华社区居民出行需求，巴士集团新辟C6路|定制巴士0006号，起讫站为上沙地铁站D出口上沙地铁站D出口。

2024年03月01日，巴士集团公共汽车分公司（石厦南车队）拆分：B821路划转至公共汽车分公司（梅林车队）；B955路、B957路、M390路、C6路|定制巴士0006号、C7路|定制巴士0007号、福田欢乐购D线|H546路|定制巴士0493号划转至公共汽车分公司（福保车队）。

2024年11月01日，巴士集团C6路|定制巴士0006号暂停运营。