2009年11月15日，烟台公交新辟86路，起讫站为曲家庄火车站北广场；45路（开元公交场站两甲埠）线路延伸，起讫站调整为开元公交场站东马家都；5路马家都线、53路石家疃线停止运营。

2017年05月20日，烟台公交西南河站点撤销，涉及21路、22路、42路、43路、44路、46路、80路、80路拥军专线、86路、86路拥军专线。

2019年07月01日，烟台公交86路（曲家庄火车站北广场）缩线行驶，起讫站调整为烟台南站火车站北广场。

2019年12月21日，烟台公交86路（烟台南站火车站北广场）线路延伸，起讫站调整为两甲埠火车站北广场。

2020年10月30日，烟台公交86路（两甲埠场站（桐林路）火车站北广场）调整走向，起讫站调整为两甲埠场站（港城东大街）火车站北广场。

2021年10月30日，烟台公交86路（两甲埠场站（迎春大街、港城东大街）火车站北广场）调整走向，起讫站调整为两甲埠场站（凤凰大街、凤凰东路）火车站北广场。

2022年05月21日，烟台公交新购置的18辆银隆GTQ6126BEVBT20型空调纯电动公交车辆，正式在86路上线运营。

2022年09月15日，烟台公交86路（两甲埠场站（绿斯达路）火车站北广场）调整走向，起讫站调整为两甲埠场站（明达西路）火车站北广场。