2020年04月11日，配合星村公路三号桥桥梁改造工程，崇明巴士南红专线临时拆分为南红专线区间（南门汽车站新村镇）、南红专线短驳（新海农场新洲不锈钢厂）。（至2020年09月01日再次调整）

2020年09月01日，配合星村公路红星桥翻建改造工程，崇明巴士南红专线临时拆分为南红专线区间（南门汽车站红星农场）、南红专线短驳（红星北店新洲不锈钢厂）。（2021年01月恢复）

2022年03月28日，根据疫情防控要求，崇明巴士所有公交线路暂停运营。

2022年05月18日，崇明巴士1711路、1731路、横沙2路、南堡专线、南新专线、南红专线恢复运营。