2020年08月17日，受前进农场阿里山路施工影响，崇明巴士堡进线、堡胜专线区间（堡镇汽车站前进农场）临时缩线行驶，起讫站调整为堡镇汽车站前柴路阿里山路；堡胜专线短驳线（长江农场前进农场）临时缩线行驶，起讫站调整为长江农场前柴路阿里山路。（计划至2020年09月30日恢复）

2022年03月20日，根据疫情防控要求，崇明巴士堡进线（堡镇汽车站前进农场）临时缩线行驶，起讫站调整为前进农场牌楼头。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，崇明巴士所有公交线路暂停运营。

2022年06月01日，崇明巴士所有线路恢复运营。