2009年07月31日，浦东巴士（由浦东公交托管）新辟新场1路、新场2路、新场3路。

2011年12月，浦东杨高（芦潮港分公司）、浦东南汇资产重组。原浦东杨高（芦潮港分公司）全部线路、浦东杨高（周浦分公司）部分线路并入浦东南汇，沪南线、周南线、南南线由浦东杨高、浦东南汇共同运营。原浦东南汇周康地区村村通公交同步划归浦东杨高（周浦分公司）运营。

2014年08月，配合新场公交枢纽站投入使用，浦东南汇新场1路、新场2路、新场3路、新场5路，巴士六汽628路终点站调整至新环西路笋心路。

2015年04月22日，浦东南汇新场3路（新环西路笋心路航三公路申江南路）线路延伸，起讫站调整为新环西路笋心路祝航路中心村路。

2020年02月13日，配合上海市疫情防控措施，航三路莲航路口封闭，浦东南汇新场3路（新环西路笋心路祝航路中心村路）起讫站临时调整为新环西路笋心路蒋桥村。2020年04月03日恢复。

2020年09月19日，配合笋王路、祝航路道路升级工程，浦东南汇新场5路（新环西路笋心路笋王路众安21组）临时缩线行驶，起讫站调整为新环西路笋心路众园路王桥村26组；新场3路（新环西路笋心路祝航路下盐路）临时缩线行驶，起讫站调整为新环西路笋心路航三路蒋桥村。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，浦东公交（浦东杨高、浦东上南、浦东金高、浦东南汇）除机场七线外所有线路暂停运营。

2022年05月30日，浦东南汇1035路、1036路、1040路、1041路、1062路、1065路、1072路、1079路、1082路、1086路、1087路、1088路、1089路、1092路、1093路、1095路、1101路、1121路、1128路、1132路、1137路、浦东8路、浦东53路、浦东57路、浦东59路、浦东71路、浦东87路、浦东93路、浦东98路、浦东99路、浦东102路、川沙5路、大团2路、惠南2路、惠南8路、惠南10路、老港1路、六灶2路、南园1路、新场1路、新场2路、新场3路、新场5路、宣桥1路、祝桥1路、祝桥3路、龙大专线恢复运营。