2006年01月27日，公交总公司44路（雨花台南大门太平门东）线路延伸，起讫站调整为雨花台南大门南京车站。

2018年04月28日，江南公交44路（雨花台南大门南京站·南广场东）调整走向，起讫站调整为宁双路东兰园。

2021年05月01日，南京公交集团第四客运公司26路、44路、46路、61路、75路、88路、98路、99路、103路、111路、113路、127路、171路、338路、340路、Y8路划归第三客运公司运营管理。