2013年09月26日，南京公交雅高巴士有限公司委托南京公共交通（集团）有限公司运营管理。原定改称为南京江南公交客运有限公司第六巴士公司，未实际执行。

2014年04月19日，南京公共交通（集团）有限公司完成对南京公交雅高巴士有限公司的收购，由旗下江南公交负责雅高巴士线路的运营管理。雅高巴士一车队（2路、125路、315路、游5路）划入第一巴士管理运营，二车队（17路、23路、58路、93路、115路）划入第二巴士管理运营，三车队（6路、20路、91路、133路）划入第三巴士管理运营，四车队（173路、游1路、游2路、游3路、游4路）划入第四巴士管理运营。

2014年10月01日，为优化人力资源和场站资源，江南公交内部各公司互换经营权，第一巴士2路划归第四巴士运营管理，205路划归第二巴士运营管理；第二巴士23路、58路划归第四巴士运营管理；第三巴士6路划归第五巴士运营管理；第四巴士201路、游3路划归第一巴士运营管理，181路划归第二巴士运营管理。

2021年03月10日，因地铁6号线施工需要，长途东站公交场站临时搬迁，南京公交2路、10路、28路、131路、165路、311路、Y10路起讫站临时由“长途东站”调整至墨香路总站。