2006年12月23日，浦东大众沪华线更名为799路，实施无人售票，单一票价2元。

2014年12月31日，浦东金高799路划归浦东杨高运营管理。浦东杨高1010路、1031路划归浦东金高运营管理。

2015年04月25日，浦东杨高799路（华高新村陆家嘴地铁站）调整走向，起讫站调整为源华路双桥路陆家嘴地铁站。

2020年07月11日，浦东杨高799路（源华路双桥路陆家嘴地铁站）缩线行驶，起讫站调整为源华路双桥路浦东大道金桥路。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，浦东公交（浦东杨高、浦东上南、浦东金高、浦东南汇）除机场七线外所有线路暂停运营。

2022年05月27日，浦东杨高85路、573路、614路、636路、774路、779路、792路、799路、971路、989路、990路、992路、1002路、1023路、1024路、1054路、1080路、1091路、1110路、1136路、浦东16路、浦东28路、浦东68路、浦东89路、张江1路、周康9路、周康10路恢复运营。