2005年10月18日，雅高巴士新辟125路，起讫站为白马公园燕子矶公园。

2013年09月26日，南京公交雅高巴士有限公司委托南京公共交通（集团）有限公司运营管理。原定改称为南京江南公交客运有限公司第六巴士公司，未实际执行。

2014年04月19日，南京公共交通（集团）有限公司完成对南京公交雅高巴士有限公司的收购，由旗下江南公交负责雅高巴士线路的运营管理。雅高巴士一车队（2路、125路、315路、游5路）划入第一巴士管理运营，二车队（17路、23路、58路、93路、115路）划入第二巴士管理运营，三车队（6路、20路、91路、133路）划入第三巴士管理运营，四车队（173路、游1路、游2路、游3路、游4路）划入第四巴士管理运营。

2016年07月01日，南京公交集团结束对中北巴士的托管管理，江南公交第一巴士公司旗下线路1路、3路、8路、11路、25路、28路、32路、40路、42路、45路、63路、64路、65路、66路、67路、68路、69路、71路、72路、73路、74路、76路、77路、79路、114路、122路、125路、130路、140路、143路、145路、146路、159路、176路、178路、184路、194路、195路、196路、197路、198路、199路、200路、201路、203路、206路、207路、208路、303路、308路、311路、315路、318路、319路、327路、328路、331路、332路、333路、334路、335路、336路、玉葛线、D5路、Y1路、Y19路、Y23路、B1路接驳线全面以公交集团标准运营管理，继续沿用第一巴士公司名称。

2022年10月27日，晚10时起，根据南京市疫情防控工作的相关要求，南京公交24路、64路、71路、76路、79路、101路、105路、125路、131路、140路、145路、175路、176路、177路、300路、308路、311路、331路、332路、333路、334路、336路、341路、K1路、K2路、Y2路、Y9路、Y15路、Y23路暂停服务。【至2022年11月6日恢复】