2000年09月01日，雅高巴士6路区间调整走向，起讫站调整为江苏电视塔21世纪广场，同时更名为91路。

2004年02月26日，雅高巴士91路（江苏电视塔21世纪广场）线路延伸，起讫站调整为定淮门大街西21世纪广场。

2005年11月09日，雅高巴士91路（定淮门大街西21世纪大厦）线路延伸，起讫站调整为宝船公园21世纪大厦。

2006年04月08日，雅高巴士91路（宝船公园21世纪广场）调整走向，起讫站调整为郑和南路21世纪广场。

2012年02月25日，雅高巴士91路（郑和南路21世纪广场）调整走向，起讫站调整为郑和南路白马公园。

2013年09月26日，南京公交雅高巴士有限公司委托南京公共交通（集团）有限公司运营管理。原定改称为南京江南公交客运有限公司第六巴士公司，未实际执行。

2014年04月19日，南京公共交通（集团）有限公司完成对南京公交雅高巴士有限公司的收购，由旗下江南公交负责雅高巴士线路的运营管理。雅高巴士一车队（2路、125路、315路、游5路）划入第一巴士管理运营，二车队（17路、23路、58路、93路、115路）划入第二巴士管理运营，三车队（6路、20路、91路、133路）划入第三巴士管理运营，四车队（173路、游1路、游2路、游3路、游4路）划入第四巴士管理运营。

2014年07月13日，江南公交91路（郑和南路白马公园）缩线行驶，因郑和南路公交底站租用站房拆除，为解决驾驶员如厕、吃饭、线路调度管理等问题，起讫站临时调整为龙江新城市广场白马公园。（至2014年12月4日恢复）

2018年07月27日，江南公交91路（郑和南路白马公园）线路延伸，起讫站调整为郑和南路总站白马公园。【因树人路在早晚高峰期间强制封闭道路，影响线路正常运营秩序，至2019年3月16日恢复】