2021年02月01日,巴士集团实验学校总站停止使用:357路(嶂背工业区总站实验学校总站)调整走向,起讫站调整为嶂背工业区总站科学馆地铁公交接驳站;M202路(伟禄雅苑公交总站实验学校总站)调整走向,起讫站调整为伟禄雅苑公交总站科学馆地铁公交接驳站;M460路(怡华工业区总站实验学校总站)缩线行驶,起讫站调整为怡华工业区总站深业上城总站。
2023年10月31日,巴士集团怡华工业区总站停止使用:37路(怡华工业区总站海上世界公交接驳站)缩线行驶,起讫站调整为御领公馆公交首末站海上世界公交接驳站;M460路(怡华工业区总站深业上城公交首末站)缩线行驶,起讫站调整为动物园总站深业上城公交首末站,并由第四分公司(怡华车队)划转至第四分公司(西丽车队)。
2024年03月21日,巴士集团M460路(动物园总站深业上城公交首末站)缩线行驶,起讫站调整为动物园总站上梅林公交总站。
2024年10月11日,巴士集团122路停止运营;为解决鹏城实验室周边地区出行需求,M460路(动物园总站上梅林公交总站)调整走向,起讫站调整为中兴人才公寓公交首末站上梅林公交总站;B818路(深大总医院总站深大总医院总站)调整走向并更名为M118路,起讫站调整为深大总医院总站动物园总站;F511路|定制巴士1285号同步停止运营。
2025年01月07日,巴士集团调整旗下部分车队编制:B855路由第四分公司(南山车队)划转至第四分公司(怡华车队),第四分公司(南山车队)(M109路、M228路、M475路、M539路、F195路|定制巴士1513号)整体并入第四分公司(松坪山车队);B627路由第四分公司(松坪山车队)划转至第四分公司(中山园车队);M268路由第四分公司(侨香车队)划转至第四分公司(华侨城车队);M460路由第四分公司(西丽车队)划转至第四分公司(松坪山车队);M487路由第四分公司(松坪山车队)划转至第四分公司(安托山车队)。