2023年09月18日，东部公交新辟D39路|定制巴士3689号，起讫站为凉帽山地铁站南岭村。

2023年11月07日，东部公交D39路|定制巴士3689号停止运营。

2024年04月12日，东部公交D39路|定制巴士3689号恢复运营并调整走向，起讫站调整为深圳东站西广场临时站莲花山庄东门，并由一分公司（平吉车队）划转至一分公司（慢城车队）。

2024年06月01日，东部公交调整旗下部分e巴士短接驳线路的运营模式：D29路|定制巴士3678号更名为高峰专线290号；D39路|定制巴士3689号更名为高峰专线139号；D48路|定制巴士3699号更名为高峰专线48号。