2020年04月07日，苏州公交新辟9003路高峰支线，起讫站为锦帆路北锦帆路北。

2022年02月14日，受疫情影响，苏州公交9003路高峰支线、9025路高峰支线、321路区间、高峰17号、47路支线B、47路支线C、622路区间、32路中市桥区间暂停运营。

2022年03月08日，苏州公交9003路高峰支线恢复运营。

2022年12月，苏州市公交集团有限公司集团本部调整为姑苏公交分公司，新成立子公司宝带西路分公司、葑门分公司。下属原一分公司调整为火车站分公司，原有33路、9013M路、9013路支线、9025路、9025路高峰支线、9025路区间、9026路移交至钱万里桥分公司管理，915路移交至宝带西路分公司管理。原二分公司调整为虎丘分公司，原有529路、933路移交至葑门分公司管理，101路移交至宝带西路分公司管理。原三分公司调整为新区分公司代管。原四分公司调整为东南环分公司，108路、200路、511路、9003路、9003路高峰支线、9006路、9018路、9027路、平江实验学校通学公交A线、平江实验学校通学公交B线移交至葑门分公司管理。原五分公司调整为钱万里桥分公司，40路、60路、321路、321路区间、9001路、9001路支线、9022路、9022路高峰支线A、9022路高峰支线B、9028M路、假日专线3路移交至宝带西路分公司管理。原六分公司调整为相城分公司代管。原七分公司调整为园区分公司代管。原八分公司调整为吴中分公司代管。

2024年09月01日，苏州公交9003路高峰支线停止运营。