2018年04月01日，浦东杨高施崂专线（航城七路施湾三路金桥路地铁站）缩线行驶并更名为浦东46路，起讫站调整为航城七路施湾三路荣川路德川路，实施无人售票，单一票价2元。

2019年06月22日，浦东杨高991路（思凡小区(施新路施湾二路)金桥路地铁站）调整走向，起讫点站调整为航城七路施湾三路金桥路地铁站。浦东杨高浦东46路同步暂停运营。