2016年06月28日，苏州公交261路（高浜街蠡塘路南东南环立交换乘枢纽站）缩线行驶，起讫站调整为高浜街蠡塘路南双塔；新辟9003路，起讫站为双塔双塔；新辟9004路，起讫站为苏州公园苏州公园；960路（苏州大学本部苏州大学本部）调整走向并更名为9006路。

2018年05月10日，苏州公交9004路（苏州公园苏州公园）线路延伸，起讫站调整为葑门首末站葑门首末站。

2019年08月06日，苏州公交9003路、9004路两线合并，保留9003路番号，走向调整为葑门首末站葑门首末站。