2012年09月24日，因南环西延施工，苏州公交新辟331路临时线，起讫站为袁家浜宝带西路首末站。

2014年07月01日，苏州公交331路（袁家浜宝带西路首末站）线路延伸，起讫站调整为木渎换乘枢纽站宝带西路首末站。

2016年06月18日，为配套金山南路上木渎公交换乘枢纽站启用，苏州公交快线1号、331路、621路，新区公交338路，吴中公交446路、65路、508路、583路、611路、615路、666路、668路、691路、692路调整走向，原竹园路木渎换乘枢纽站调整至木渎公交换乘枢纽站。

2020年02月05日，苏州公交331路停止运营。