2020年12月26日,第三客运分公司456路、616路、646路、专23路、专92路、专93路、专94路、快速直达专线119路、快速直达专线129路划转至第六客运分公司运营。
2022年05月12日,按照房山区疫情防控工作要求,途径房山区境内的第三客运分公司391路、964路;第六客运分公司912路采取区间运营措施;第六客运分公司616路、831路、832路、833路、837路、838路、839路、895路、896路、901路、901路快车、904路、906路、917路、917路快车、934路、951路、952路、956路、971路、993路、专93路、专94路、F11路、F12路、F13路、F14路、F16路、F17路、F18路、F19路、F20路、F21路、F22路、F23路、F24路、F25路、F28-F68路联运、F30路、F31路、F33路、F34路、F35路、F36路、F37路、F39路、F41路、F42路、F45路、F51路、F52路、F53路、F54路、F55路、F56路、F58路、F59路、F60路、F62路、F64路、F65路、F66路、F67路、F71路、F72路、F73路、F74路、F75路、F76路、F77路、F80路、F81路、F82路、F83路、F92路、通勤东湖港、通勤石花洞、通勤朱家坟、通勤向阳、快速直达专线32路、快速直达专线63路、快速直达专线86路、快速直达专线118路、快速直达专线119路、快速直达专线129路、快速直达专线130路、快速直达专线140路、快速直达专线151路、快速直达专线154路、快速直达专线176路、快速直达专线177路、快速直达专线187路、集体出行3线、三流水村专线、富合村专线、森水村专线;第八客运分公司948路采取暂停运营措施。
2023年12月18日,由于客流持续降低,为进一步优化整合运力资源,北京公交集团快速直达专线15路、快速直达专线21路、快速直达专线29路、快速直达专线40路、快速直达专线53路、快速直达专线54路、快速直达专线56路、快速直达专线58路、快速直达专线73路、快速直达专线75路、快速直达专线76路、快速直达专线81路、快速直达专线82路、快速直达专线89路、快速直达专线106路、快速直达专线119路、快速直达专线129路、快速直达专线132路、快速直达专线140路、快速直达专线146路、快速直达专线159路、快速直达专线171路、快速直达专线176路、快速直达专线221路、夜间接驳专线1号线、夜间接驳专线2号线、夜间接驳专线3号线停止运营。