1999年07月30日,大众巴士中标获得机场三线、机场六线经营权。
2000年04月14日,大众巴士新辟机场六线,起讫站为浦东国际机场桃浦路。
2004年10月03日,775路、789路、980路、隧道五线、机场六线由延安东路隧道改走复兴东路隧道。
2005年02月06日,为试行大众公交区域化经营理念,深化公交改革,大众巴士与大众真南整合挂牌,大众真南全部线路划归大众巴士运营管理。整合后,大众巴士共运营管理线路32条:(原大众公交真南分公司)62路、106路、112路(含区间)、117路、129路、213路、216路、323路、516路、517路、708路、724路、750路、766路、虎南线;(原大众巴士公司)737路、738路、810路、811路、822路(大众旅游公司)、841路、842路、844路(大众旅游公司)、846路、861路、862路、923路、943路、机场三线、机场六线、旅游5号线、旅游8号线。
2005年06月01日,大众巴士机场六线(浦东国际机场桃浦路)调整走向,起讫站调整为浦东国际机场中山公园(定西路)。
2008年11月25日,大众巴士机场六线调整运价,由多级票价2元~20元上调至多级票价2元~24元。
2010年02月24日,为配合与大众西北资产重组,大众巴士一分公司、二分公司(737路、738路、810路、841路、842路、846路、862路、923路、机场三线、机场六线)暂时合并,大众巴士托管大众旅游公司线路(822路、844路)同步并入,命名为巴士三汽七分公司。
2010年06月01日,巴士三汽原七分公司部分线路(737路、738路、846路、923路、机场三线、机场六线)成立六分公司。
2011年06月03日,巴士三汽机场六线调整运营时间,调整后浦东国际机场的首末班车时间为21:00~24:00。