2013年10月，浦东南汇保税港区1线(申港2路)更名为自贸试验区洋山1线。

2014年03月10日，浦东南汇自贸试验区洋山1线（顺翔路同汇路顺翔路同汇路）线路延伸，起讫站调整为水芸路水松路水芸路水松路。

2017年07月22日，配合道路施工，浦东南汇自贸试验区洋山1线水芸路水松路终点站调整至滴水湖地铁站（枢纽站内）。

2020年08月01日，浦东南汇自贸试验区洋山1线（滴水湖地铁站滴水湖地铁站）缩线行驶，起讫站调整为滴水湖地铁站深水港商务广场。同步取消原双休日、国定节假日停驶的运营方式。

2020年08月05日，浦东南汇自贸试验区洋山1线恢复原线路行驶，起讫站恢复为滴水湖地铁站滴水湖地铁站。同步调整运营方式，双休日及国定假日停运。

2022年01月01日，浦东南汇三分公司所有线路划入临港公交运营管理。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，临港公交所有公交线路暂停运营。

2022年06月01日，除洋山专线外，临港公交所有线路恢复运营。

2023年11月06日，为配合滴水湖公交枢纽站施工，临港公交1043路、浦东33路、洋山专线、自贸试验区洋山1线、环湖一路观光线滴水湖地铁站终点站临时调整为云鹃路临港大道；1009路、1096路、申港1路、上海电机学院接驳线终点站滴水湖地铁站临时调整为山兰路临港大道。

2024年04月07日，临港公交自贸试验区洋山1线（滴水湖地铁站滴水湖地铁站）调整走向，起讫站调整为云鹃路临港大道临港共享区枢纽站，并更名为临港定制11线，票价调整为单一2元。