2001年03月26日,公交总公司9路专线(前门金台路)变更为729路、829路;22路专线(前门颐和园)变更为726路、826路;35路专线(天桥大郊亭)变更为745路;40路专线(五路木樨园)变更为724路、824路;300路内环专线(玉泉营环三环家居玉泉营环三环家居)、300路外环专线(航天桥航天桥)、300路内环空调(城外诚家具商场城外诚家具商场)、300路外环空调(和平街北口和平街北口)分别变更为730路内环、730路外环、830路内环、830路外环;302路专线(辛庄人民大学)变更为731路、831路;320路专线(北京西站西苑)变更为827路,320路支专线(北京西站西苑)变更为727路;332路专线(动物园颐和园)变更为732路、832路,同时因西直门外大街扩建工程以及动物园枢纽动工,延长为展览馆颐和园;358路专线(安定门立水桥、安定门天通苑小区)分别变更为758路、858路;374路专线(太平桥东里颐和园南门)变更为704路;石景山专线(石景山北京西站)变更为747路。上述线路同时划归北京巴士运营。
2004年02月28日,北京巴士858路(安定门天通苑小区)延长为天通苑东二区康家沟。
2004年03月08日,因启用天通北苑新停车场,第三客运分公司323路(七里庄小营北站)延长为七里庄天通北苑;第一客运分公司358路(安定门中滩北站)延长为安定门天通北苑,同时保留原安定门中滩北站车次为358路区间;北京巴士849路(青塔小区天通苑小区)延长为青塔小区天通北苑;858路(天通苑东二区康家沟)延长为天通北苑康家沟。
2009年08月26日,快速公交3线支线|BRT3支线(安定门天通北苑)开通,由第一客运分公司运营。配合快速公交3线支线开通,合理配置公交资源,第一客运分公司358路(安定门东站天通北苑)停止运营;358路区间(安定门东站中滩北站)更名为558路;新奥客运分公司850路(北七家村张仪村南站)缩短为张仪村南站北官厅,同时变更路号为612路;851路(张仪村南站南七家)缩短为张仪村南站国家体育场东(鸟巢),同时变更路号为611路;858路(天通北苑康家沟)缩短为康家沟和平东桥,同时变更路号为75路。