2013年12月29日，浦东南汇新辟惠南6路，起讫站为听潮路拱乐路宣中路宣中支路（欣秋苑）。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，浦东公交（浦东杨高、浦东上南、浦东金高、浦东南汇）除机场七线外所有线路暂停运营。

2022年05月22日，浦东南汇188路、1066路、1068路、1070路、1073路、1109路、1111路、航头5路、惠南6路、南新专线恢复运营。

2023年06月01日，浦东南汇部分线路分公司调整：一分公司1038路、1082路、惠南10路、南南线划入二分公司，浦东98路划入六分公司；二分公司浦东30路、浦东31路、浦东79路划入一分公司，浦东70路划入五分公司；六分公司1070路、1137路、1138路、惠南2路、惠南3路、惠南4路、惠南6路、惠南8路、南园1路划入一分公司，浦东57路划入二分公司。

2024年03月01日，浦东南汇分公司线路归属重新划分：原一分、二分公司合并成立惠南分公司，原五分公司更名为川沙分公司，原六分公司更名为新场分公司。原一分公司806路、1062路、1070路、1137路、1138路、南园1路、大团2路、惠南2路、惠南3路、惠南4路、惠南6路、惠南8路、浦东105路划入新场分公司，原二分公司840路、浦东92路、南南线划入川沙分公司，原二分公司浦东57路、浦东96路划入新场分公司。