2017年09月08日，崇明巴士南同专线、南跃线、南风线始发站由南门汽车站搬迁至南门水陆换乘中心。

2021年05月12日，配合花博园试运营及正式开幕，崇明巴士南同专线、堡胜专线全程车、崇明乡村10路延伸至花博园P1停车场；南江专线、南东专线改道行驶。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，崇明巴士所有公交线路暂停运营。

2022年05月20日，崇明巴士恢复多条线路部分区间运营：南东专线恢复南门汽车站东纺厂区间运营；南隆专线恢复南门汽车站长征农场区间运营；南同专线恢复南门汽车站东平商店区间运营；堡胜专线恢复堡镇汽车站长江农场区间运营。

2025年03月01日，崇明巴士南同专线调整走向并更名为崇明乡村2路，同步实行无人售票，单一票价2元。