2009年07月08日，受甘雨桥断路施工影响先期采取双向区间措施运营的732路（颐和园动物园、鹿海园小区刘家窑桥东）和743路（中央党校北门西直门南、西直河光明楼）正式进行调整。双层客运分公司732路（颐和园鹿海园小区）调整走向并缩短为鹿海园小区北京南站南广场，同时变更路号为665路；专线客运分公司743路（中央党校北门西直河）拆分为561路（西直河龙潭湖）和562路（中央党校北门西直门南）。

2010年01月26日，第一客运分公司24路、201路、379路、614路划转至第七客运分公司；8路、42路、60路划转至电车客运分公司；305路划转至新奥客运分公司。第二客运分公司20路、203路划转至第六客运分公司；300路内环划转至新奥客运分公司。第四客运分公司7路划转至第二客运分公司；10路、204路内环、204路外环、334路划转至第六客运分公司。第五客运分公司352路划转至第二客运分公司；359路划转至第七客运分公司；300路外环、378路、439路划转至新奥客运分公司。第六客运分公司631路、631路快车划转至第二客运分公司；356路、480路划转至第三客运分公司；58路、212路、311路、318路、327路、385路、396路、663路划转至双层客运分公司。第七客运分公司119路、125路、407路、426路划转至第一客运分公司；104路快车、110路、116路、515路、823路划转至电车客运分公司。电车客运分公司653路划转至第一客运分公司；410路、456路划转至第二客运分公司；411路划转至第五客运分公司。新奥客运分公司681路、699路、839路划转至第一客运分公司，477路、658路、694路、697路、717路划转至第三客运分公司；509路、518路划转至第四客运分公司；75路、635路、718路划转至第五客运分公司；64路、611路、612路划转至第六客运分公司；605路、682路、701路划转至第七客运分公司。专线客运分公司482路、498路、562路划转至第四客运分公司；457路、561路划转至第五客运分公司；802路划转至第六客运分公司；467路、660路、677路划转至第七客运分公司。双层客运分公司504路、679路划转至第二客运分公司；678路、692路划转至第三客运分公司；489路、746路划转至第四客运分公司；527路、728路划转至第六客运分公司；707路划转至第七客运分公司。

2014年08月26日，第四客运分公司562路（中央党校北门西直门南、车公庄北中央党校北门）缩短为中央党校北门北太平桥西。

2017年11月17日，第四客运分公司撤销429路（东北旺中路志新桥西）、562路（中央党校北门北太平桥西）；375路（西直门北韩家川）同步调整为西直门北东北旺中路；替代原375路北段走向，特6路（韩家川南站北京西站）调整中途走向同时更名为394路；替代原562路部分走向，509路（地铁西二旗站西苑枢纽站）同步调整为地铁西二旗站中央党校北门。