2004年07月31日，第六客运分公司501路（苹果园五一剧场）路号变更为58路。

2010年01月26日，第一客运分公司24路、201路、379路、614路划转至第七客运分公司；8路、42路、60路划转至电车客运分公司；305路划转至新奥客运分公司。第二客运分公司20路、203路划转至第六客运分公司；300路内环划转至新奥客运分公司。第四客运分公司7路划转至第二客运分公司；10路、204路内环、204路外环、334路划转至第六客运分公司。第五客运分公司352路划转至第二客运分公司；359路划转至第七客运分公司；300路外环、378路、439路划转至新奥客运分公司。第六客运分公司631路、631路快车划转至第二客运分公司；356路、480路划转至第三客运分公司；58路、212路、311路、318路、327路、385路、396路、663路划转至双层客运分公司。第七客运分公司119路、125路、407路、426路划转至第一客运分公司；104路快车、110路、116路、515路、823路划转至电车客运分公司。电车客运分公司653路划转至第一客运分公司；410路、456路划转至第二客运分公司；411路划转至第五客运分公司。新奥客运分公司681路、699路、839路划转至第一客运分公司，477路、658路、694路、697路、717路划转至第三客运分公司；509路、518路划转至第四客运分公司；75路、635路、718路划转至第五客运分公司；64路、611路、612路划转至第六客运分公司；605路、682路、701路划转至第七客运分公司。专线客运分公司482路、498路、562路划转至第四客运分公司；457路、561路划转至第五客运分公司；802路划转至第六客运分公司；467路、660路、677路划转至第七客运分公司。双层客运分公司504路、679路划转至第二客运分公司；678路、692路划转至第三客运分公司；489路、746路划转至第四客运分公司；527路、728路划转至第六客运分公司；707路划转至第七客运分公司。

2014年03月26日，北京公交集团427路（龙锦苑公交场站城铁回龙观站）变更为专101路；429路（城铁龙泽苑站东村家园东门）变更为专102路；442路（城铁龙泽苑站城铁龙泽苑站）变更为专103路；444路（城铁霍营站建材城东里）变更为专104路，首末站调整为霍营公交场站建材城东里；491路（朝凤庵村朝凤庵村）变更为专105路；492路（朝凤庵村朝凤庵村）变更为专106路；517路（北苑家园天通北苑一区南）变更为专107路；58路（苹果园南五一剧场）变更为专108路；311路（苹果园南工人疗养院）变更为专109路；564路（鲁谷公交场站绿谷雅园小区）变更为专110路；440路（东大桥石佛营西里东站）变更为专111路；446路（望京北路东口城铁望京西站）变更为专112路；495路（四惠枢纽站百子湾家园东站）变更为专113路；424路（南十里居单店）变更为专114路；566路（草房西路南口杨闸）变更为专115路；572路（南皋站善各庄）变更为专116路；417路（燕丹天通西苑南）变更为专117路；522路（白坊地铁天通苑北站）变更为专118路；533路（海䴖落地铁天通苑北站）变更为专119路；540路（龙祥嘉园地铁北苑路北站）变更为专120路；548路（二拔子新村城铁回龙观站）变更为专121路；590路（东湖三元桥东站）变更为专122路。