1956年05月，公共汽车公司接管了一系列原私营车运营线路：原颐和园温泉的私营车线路变更为61路，同时延长为西直门北安河；原西直门八大处的私营车线路变更为62路；原南苑三槐堂的私营车线路变更为64路；原东大桥东坝的私营车线路变更为65路。

1957年07月，公共汽车公司61路（西直门北安河）缩短为颐和园温泉并更名为46路，62路（西直门八大处）更名为47路，64路（南苑三槐堂）更名为49路，南苑站更名为三营门；65路（东大桥东坝）更名为50路。

1958年09月01日，公共汽车公司49路（三营门三槐堂）延长为三营门南大红门。

1972年11月，公共汽车公司在整理1972年客流调查资料后，提出开调线路的方案时，发现市区线路编号以30路为上限已不够使用，于是把由公共汽车所辖的郊区线路编号加上300。31路（平安里中关村）更名为331路；32路（动物园颐和园）更名为332路；33路（颐和园香山）更名为333路；34路（动物园永定路）更名为334路；35路（展览路丰台火车站）更名为335路；36路（展览路门头沟）更名为336路；37路（宣武门石景山）更名为337路；38路（宣武门永乐小区）更名为338路；39路（广安门云岗）更名为339路；40路（广安门丰台）更名为340路；41路（永定门万源路）更名为341路；42路（郎家园万寿宫/造纸厂）取消高峰时间联运，改为342路（郎家园通县）和317路（通县造纸厂）；43路（虎坊路三营门）更名为343路；44路（德胜门回龙观）更名为344路；45路（德胜门昌平）更名为345路；46路（颐和园温泉/西山农场）更名为346路；47路（动物园八大处）更名为347路；48路（方巾巷炼焦厂）更名为348路；49路（三营门南大红门）更名为349路；50路（朝阳门东坝）更名为350路；51路（右安门丰台）更名为351路；52路（光明楼小红门）更名为352路；53路（三营门丰台）更名为353路；54路（丰台火车站石景山）更名为354路；55路（中关村清河）更名为355路；56路（云岗大灰厂）更名为356路；57路（昌平高崖口）更名为357路；58路（安定门立水桥）缩短为地坛立水桥，同时更名为358路；59路（东直门首都机场）更名为359路；60路（动物园香山）更名为360路；61路（三营门旧宫）更名为361路；62路（颐和园东北旺公社）更名为362路；63路（八王坟红庄）更名为363路；64路（八王坟金盏路）更名为364路；65路（中关村体育学院）更名为365路；66路（永定门黄村）更名为366路。

1997年07月26日，公交总公司349路（三营门南大红门）延长为三营门垡上。

1998年09月25日，第二客运分公司341路（木樨园万源路）延长为木樨园德茂庄，343路（虎坊路三营门）延长为虎坊路万源路，349路（三营门垡上）缩短为德茂庄垡上，353路（三营门马场）延长为万源路马场。

2001年11月08日，第二客运分公司341路（木樨园德茂庄）延长为木樨园青云店镇，同步撤销349路（德茂庄垡上）。